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Text File  |  1995-03-04  |  3.6 KB  |  75 lines
  1. **************************
  2. * Disintegrins signature *
  3. **************************
  4.  
  5. Disintegrins [1,2]  are  snake  venom   proteins   which  inhibit   fibrinogen
  6. interaction  with  platelet  receptors  expressed on the glycoprotein IIb-IIIa
  7. complex. They act by binding to the integrin glycoprotein IIb-IIIa receptor on
  8. the  platelet  surface and  inhibit  aggregation  induced  by  ADP,  thrombin,
  9. platelet-activating factor and collagen.
  10.  
  11. Disintegrins are peptides of about  70 amino  acid residues that contain  many
  12. cysteines all  involved  in disulfide bonds [3].  Disintegrins contain an Arg-
  13. Gly-Asp (RGD) sequence, a recognition site of many adhesion proteins.  The RGD
  14. sequence  of disintegrins is postulated to interact with the glycoprotein IIb-
  15. IIIa complex.
  16.  
  17. The sequences of disintegrins from  different  snake  species are known. These
  18. proteins  are  known  as:  albolabrin,   applagin,  barbourin,  batroxostatin,
  19. bitistatin, echistatin, elegantin, eristicophin, flavoridin, halysin, kistrin,
  20. tergeminin and triflavin.
  21.  
  22. Some other proteins are known to contain a disintegrin domain:
  23.  
  24.  - Some  snake    venom  zinc metalloproteinases [4]  consist of an N-terminal
  25.    catalytic domain  fused  to  a  disintegrin  domain.  Such  is the case for
  26.    trimerelysin I    (HR1B),   atrolysin e (Ht-e)  and  trigramin. It has been
  27.    suggested  that  these proteinases  are  able to cleave themselves from the
  28.    disintegrin domains  and  that  the  latter  may  arise  from  such a post-
  29.    translational processing.
  30.  - The beta-subunit of guinea pig  sperm surface protein PH30 [5].   PH30 is a
  31.    protein involved  in  sperm-egg fusion.   The   beta   subunit  contains  a
  32.    disintegrin at the N-terminal extremity.
  33.  - Mammalian epididymial protein 1 (EAP I) [6].  EAP I is  associated with the
  34.    sperm membrane and may play a role in sperm maturation. Structurally, EAP I
  35.    consists of  an  N-terminal  domain,  followed  by a zinc metalloproteinase
  36.    domain, a disintegrin domain, and a large C-terminal domain that contains a
  37.    transmembrane region.
  38.  
  39. The schematic  representation  of  the  structure  of a typical disintegrin is
  40. shown below:
  41.  
  42.                                    +---+
  43.        +--------+             +----|---|--------------------+
  44.        |        |             |    |   |                    |
  45.   xxxxxCxCxxxxxxCCxxxxCxxxxxxxCxxxxCCxxCxxxxxxxxCxxxRGDxxxxxCxxxxxxCxxxxxxx
  46.          |       |    |       ******|***********|*                 |
  47.          +-------+    +-------------+           +------------------+
  48.  
  49. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  50. '*': position of the pattern.
  51.  
  52. As a  signature  pattern  for  disintegrins,  we  selected a conserved central
  53. region that contains five of the cysteines involved in disulfide bonds.
  54.  
  55. -Consensus pattern: C-x(2)-G-x-C-C-x-[NQRS]-C-x-[FM]-x(6)-C-[RK]
  56. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  57. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  58. -Last update: December 1992 / Pattern and text revised.
  59.  
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